隨著中國市場化改革的推進，探索公有制在市場經濟條件下合理有效、多樣性的實現形式，就成為國有企業改革的歷史使命，也成為國有企業改革的目標規定性。這種實現形式來自經濟基礎的內在要求，是公有制微觀主體的內在利益要求的實現形式，而不由政府行政權力強力維護和支配。同時這種實現形式又能夠與市場經濟體制相吻合，能夠在市場經濟體制下存在、運行、發展。社會主義市場經濟體制作為我國基本經濟體制，決定了國有企業改革的具體制度選擇，就是構建與市場經濟體制相適應的現代企業制度，實現公有制經濟與市場經濟體制的有機融合。由此決定了國有企業改革的目標模式是公有制在市場經濟條件下的實現形式，即擁有國有資產股權、股份的公司制現代企業制度。

以建立和完善現代企業制度為國有企業改革的目標模式，在內在邏輯上要完成幾個環節的轉換。首先是把公有制財產轉換為可以在市場經濟體制下運行的資產、資本的形式，形成國有資產、國有資本；進而把國有資產、國有資本明確量化，形成可以自主流轉、自由組合的微觀權利單元；這些權利單元形成投資者可以購買或轉讓、市場上可以估價及流轉的股份；這些股份自主組合成股份制公司，形成市場經濟體制下可以追求自身經濟利益的微觀主體；這些微觀主體具有了追求資產保值增值、追求資本收益最大化的內在利益動力；公有制經濟具有了適應市場經濟體制運行要求、不依賴于政府行政權力強力維持、富有內在利益驅動的微觀實現主體及其實現形式；公有制經濟實現市場化運行要求，公有制的經濟基礎成為真正的經濟基礎。

以現代企業制度作為國有企業改革的目標模式，就是以公司制為主要實現形式來實現公有制經濟在市場經濟體制下存在、運行、發展壯大的基本經濟制度要求。

當前及今后國有企業改革的重心是深化運行模式的改革。明確了國有企業改革的目標要求就是實現公有制經濟的市場化運行，也明確了國有企業改革的目標模式是建立和完善現代企業制度。目標模式是一個靜態的規定性，而在日常的經濟運行中，國有企業改革還需要解決動態的運行模式問題，即解決公有制經濟市場化運行的具體操作問題。也就是說，在國企改革的初期，在邏輯上，我們首先要明確國企為什么要改革，改成什么樣，這是目標模式要解決的問題。而在明確了國企改革的目標模式之后，我們需要解決的就是怎樣使得國有企業真正按照現代企業制度的組織框架和規則體現，有效地運行起來。因此，深化國有企業的改革，不是在目標模式上繼續爭論或陷入動搖，而是要在具體運行模式上深入探索，使得現代企業制度的內在要求，真正外化成為企業的運行機制、運行行為。

運行模式的改革側重的是企業行為的改革。國有企業改革的目標模式解決的是改革的基本制度規定性問題。國有企業改革的運行模式，則是著眼于解決企業的行為問題。制度就是行為規則，制度的基本構成包括兩個大的基本方面，一是行為規則的基本規定，一是行為規則的實施機制。如果說改革的目標模式確定的是行為規則的基本規定性，那么改革的運行模式則確定的是行為規則的具體的實施機制。國有企業改革的目標模式，是由我國的基本經濟制度和基本經濟體制所決定的，它確定了國企改革不可違背的基本制度規定性，確定了國企改革基本的行為規則。但行為規則的明確不等于行為規則的落地，要想讓所規定的行為規則真正在企業的行為中得到體現、遵守、實施，就必須構建相應的實施機制，即構建使得行為規則真正落地的運行模式。如果說國企改革的目標模式指明了改革的根本方向，那么國企改革的運行模式則是改革方向、改革目的的實現路徑。